Responsable du pôle de bio-informatique F/H, Nanterre

Fonctions Responsable du pôle de bio-informatique.

Catégorie A

Corps IGR

BAP A

Type de contrat CDD de 1 an, renouvelable.À pourvoir dès que possible.

Mission Le/la responsable du pôle de bio-informatique assure le développement et l'automatisation des workflows d'analyse de données omiques, la structuration des bases de données et des systèmes d'information, ainsi que l'implémentation et le développement des programmes informatiques associés aux plateformes automatisées de l'unité.

Activités principales

Concevoir des workflows automatisés pour l'analyse de données ou le pilotage d'instruments

Concevoir etélaborer la structure de bases de données et de systèmes d'information permettant de collecter, structurer, stocker et mettre en relation les données

Guider le déploiement de l'infrastructure informatique des plateformes de la BFASU

Définir le plan d'étude et de recueil des données le mieux adapté au problème posé

Analyser des données de génomique (séquençage), protéomique et métabolomique (MS)

Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques, de publications ou de présentations orales auprès des communautés professionnelles et scientifiques

Gérer l'ensemble des moyens techniques alloués aux dispositifs de collecte et de traitement de données

Former, en interne et en externe, aux principes età la mise en œuvre des techniques de l'analyse des données biologiques

Orienter et conseiller les utilisateurs pour la mise enœuvre des méthodes d'études et d'interprétation des résultats

Conduite de projets Oui

Encadrement Non

Connaissances transversales requises

Connaissance théorique des différents types de protocoles expérimentaux biologiques

Connaissance approfondie des méthodes de recueil, d'analyse et de traitement des données

Connaissance solide en informatique : maîtrise des systèmes UNIX/LINUX, clusters de calculs, maîtrise d'un ou plusieurs langages de programmation, dont obligatoirement Python (Bash, C++, R, JavaScript, HTML, PHP, Java, PERL), maîtrise de la gestion des bases de données SQL et interfaces web (Apache, Django). Maîtrise de logiciels degestion de version (Git, GitLab)

Maîtrise des problématiques liées aux Big Data

Connaissance générale des approches d'IA/ML appliquées à l'ingénierie du vivant

Langue anglaise : B2à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)

Savoir-faire

Maîtrise des techniques principales d'analyse statistique de données scientifiques (paramétrique/non-paramétrique/bayésien)

Savoir développer des outils de traitements automatisés de données biologiques pour les appliquer à des technologies de recherche en biologie

Rédiger des documents scientifiques et assurer une gestion des projets scientifiques

Développer une expertise scientifique et technologique

Encadrer desétudiant-es

Gérer la confidentialité des projets (NDA, propriété intellectuelle, secret des affaires)

Savoir-être

Aptitudeà s'inscrire dans des projets collectifs et goût du travail en équipe

Capacité d'innovation et de créativité, d'initiative et autonomie dans le travail

Rigueur, organisation, méthode

Diplôme réglementaire souhaité

Doctorat

Domaine de formation souhaité : bioinformatique

#J-18808-Ljbffr